實時熒光定量聚合酶鏈式反應（PCR）指的是在PCR進行的同時，對其過程進行監(jiān)測的能力（即實時）。因此，數(shù)據(jù)可在PCR擴增過程中，而非PCR結束之后，進行收集。這為基于PCR的DNA和RNA定量方法帶來了革命性的變革。在
熒光定量PCR(qPCR)中，反應以循環(huán)中檢測到目標擴增的時間點為特征，而非在一定循環(huán)數(shù)后目標分子累計的擴增量。目標核酸的起始拷貝數(shù)越高，則會越快觀察到熒光的顯著增加。相反，終點法檢測（也稱“讀板檢測”）測量的是PCR循環(huán)結束時累計的PCR產(chǎn)物量。
熒光定量PCR將PCR擴增和檢測合并為單一步驟。這樣就無需使用凝膠電泳進行產(chǎn)物檢測，更重要的是這一方法是真正定量的。在熒光定量PCR中，熒光染料被用來在熱循環(huán)中標記PCR產(chǎn)物。熒光定量PCR儀器在反應的對數(shù)期測定熒光信號的積累，獲得快速的PCR產(chǎn)物定量以及客觀的數(shù)據(jù)分析。
熒光定量PCR分析常見術語：
擴增子：PCR過程而產(chǎn)生的DNA短片段
擴增曲線：根據(jù)熒光信號相對于循環(huán)數(shù)而制作的曲線
基線：PCR起始時，熒光信號還未發(fā)生變化的幾個循環(huán)
Ct（閾值循環(huán)）：熒光信號超過NTC（無模板對照樣品）固定閾值時的循環(huán)數(shù)。用于對擴增質(zhì)量進行驗證。
核酸目標：（也稱為“目標模板”）——需要擴增的DNA或RNA序列
惰性參比染料：一種可作為內(nèi)部對照，以用于在數(shù)據(jù)分析時對報告基團染料信號進行均一化的染料。均一化是對因濃度或體積變化而隨之引起波動進行的必要校正。所有的SDSPCR試劑盒都提供了參比熒光對照。
Rn（均一化報告基團）：報告基團染料釋放的熒光強度除以惰性參比染料釋放的熒光強度
Rn+：一次反應的Rn值包含所有的組分，包括模板
Rn-：未反應樣品的Rn值。Rn值可通過以下方式獲取：
實時熒光定量PCR(qPCR)運行的早期循環(huán)（產(chǎn)生可被檢測的熒光信號之前的循環(huán)），或不含有任何模板的反應。
ΔRn(deltaRn)：在特定PCR條件設置下所產(chǎn)生的信號量級。
ΔRn可通過以下公式計算：(Rn+)–(Rn-)標準品具有已知濃度的A樣本，用于繪制標準曲線。通過使用不同濃度的標準品，您可構建用于未知樣品定量分析的標準曲線。
閾值：早期PCR循環(huán)時Rn值的平均標準差，乘以相應的校正系數(shù)閾值應當設定在PCR指數(shù)擴增時的相關區(qū)域。
未知：具有未知模板量的樣品。即，您需要進行檢測的樣品。
